Das Mikrobiom ist ein Schlüsselfaktor für die Reproduzierbarkeit von Forschungsergebnissen. Die Zahl der Mikroorganismen wie Bakterien, Viren und Pilze übertrifft die Zahl der Körperzellen um ein Vielfaches, und es können bis zu 1000 unterschiedliche Spezies nachgewiesen werden. 

Das Darmmikrobiom ist von entscheidender Bedeutung für eine Vielzahl von experimentellen Untersuchungen. Es ist bekannt, dass es die Physiologie und den Phänotyp von Versuchstieren vielfältig beeinflusst. Dies konnte für verschiedenste Krankheitsmodelle wie z.B. Diabetes, Adipositas, chronische Entzündungen, immunologische oder neurologische Erkrankungen nachgewiesen werden.

Das Mikrobiom von Tieren unterschiedlicher Züchter kann sich selbst bei genetisch identischen Tieren deutlich unterscheiden und unterliegt im Gegensatz zum genetischen Profil der Tiere einem ständigen Wandel. Selbst geringfügige Veränderungen in der Haltung der Tiere wie Besatzdichte, Ernährung, Medikation etc. können einen signifikanten Einfluss auf die Zusammensetzung des Mikrobioms haben und die Ergebnisse von Experimenten beeinflussen.

Die GVG Diagnostics GmbH hat daher ein eigenes Mikrobiom-Analyse-Programm für Labortiere entwickelt, um Mikrobiomprofile umfassend und reproduzierbar zu erstellen:

• Dieses umfasst eine für Mikrobiomstudien optimierte Isolation genetischen Materials.
• Eine anschließende NGS (Next Generation Sequencing) basierte Shotgun-Sequenzierung ermöglicht eine umfassende Analyse des Mikrobioms und der darin enthalten Bakterien, Viren oder Pilze. Das Verfahren ist zwar analytisch aufwendiger als die häufig verwendete 16S rRNA Methode, allerdings um ein Vielfaches flexibler und deutlich aussagekräftiger.
• Anschließend erfolgt eine umfangreiche bioinformatische Analyse und statistische Auswertung der Daten. Durch die Verwendung einer umfassenden und regelmäßig aktualisierten Datenbank kann eine sehr große Anzahl von Mikroorganismen taxonomisch bis auf Spezies- und Sub-Spezies-Ebene identifiziert werden.

Somit können wir ein umfassendes und exaktes Mikrobiom-Profil Ihrer Labortiere erstellen. Die Darstellung der Ergebnisse kann dabei an Ihre Verwendungswünsche und Bedürfnisse angepasst werden.